Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RND2P52198 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RND2P52198 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RND2P52198 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RND2P52198 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RND2P52198 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RND2P52198 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RND2P52198 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RND2P52198 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms