Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX5P50542 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX5P50542 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX5P50542 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PEX5P50542 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PEX5P50542 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PEX5P50542 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PEX5P50542 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX5P50542 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX5P50542 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX5P50542 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms