Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC34P49427 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC34P49427 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC34P49427 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC34P49427 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms