Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLD2P49005 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLD2P49005 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLD2P49005 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD2P49005 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD2P49005 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD2P49005 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD2P49005 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD2P49005 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD2P49005 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD2P49005 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLD2P49005 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms