Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTRLP40313 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTRLP40313 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTRLP40313 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTRLP40313 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTRLP40313 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTRLP40313 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTRLP40313 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTRLP40313 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms