Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms