Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IL7RP16871 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IL7RP16871 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IL7RP16871 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL7RP16871 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL7RP16871 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms