Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms