Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR29P0C7W0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms