Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA21P01568 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms