Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB11O95342 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms