Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms