Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ATP5A1-218ENST00000592364 576 ntTSL 511.25□□□□□ -0.614e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 510.96□□□□□ -0.654e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.794e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-212ENST00000590324 807 ntTSL 59.87□□□□□ -0.834e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-203ENST00000585650 520 ntTSL 56.17□□□□□ -1.424e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.783e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.263e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.633e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 SF3B1-203ENST00000414174 593 ntTSL 43.7□□□□□ -1.823e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 RECK-203ENST00000479053 1717 ntTSL 1 (best)23.58■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 RECK-202ENST00000475774 1128 ntTSL 518.49■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 WDR45B-203ENST00000571817 889 ntTSL 320.77■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 WDR45B-208ENST00000574828 765 ntTSL 316.09■□□□□ 0.171e-9■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 WDR45B-206ENST00000573616 896 ntTSL 514.17□□□□□ -0.141e-9■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.062e-19■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C17orf58-203ENST00000536693 1654 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.032e-19■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.952e-19■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-19■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.111e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.681e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 GNAZ-202ENST00000492538 652 ntTSL 422.59■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 MCUR1-202ENST00000488770 1826 ntTSL 222.45■■□□□ 1.198e-11■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.588e-11■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 TMED2-202ENST00000438031 603 ntTSL 426.16■■□□□ 1.782e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.622e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 TMED2-204ENST00000543425 1350 ntTSL 314.52□□□□□ -0.082e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 TMED2-205ENST00000544188 433 ntTSL 212.13□□□□□ -0.472e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 SURF1-203ENST00000463965 493 ntTSL 327.08■■□□□ 1.933e-26■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 B4GALT7-205ENST00000505468 544 ntTSL 515.8■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-13■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.962e-14■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.527e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.437e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 223.87■■□□□ 1.417e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 323.87■■□□□ 1.417e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.357e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 523.2■■□□□ 1.37e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.257e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.237e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ZFYVE21-203ENST00000553512 636 ntTSL 522.31■■□□□ 1.162e-14■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 221.34■■□□□ 1.017e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.967e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.837e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.87e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 319.75■□□□□ 0.757e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-14■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 419.04■□□□□ 0.647e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.557e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.547e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 518.22■□□□□ 0.517e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 517.74■□□□□ 0.437e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 317.74■□□□□ 0.437e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 217.74■□□□□ 0.437e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.437e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ZFYVE21-205ENST00000554255 570 ntTSL 217.54■□□□□ 0.42e-14■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 517.44■□□□□ 0.387e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 TNFAIP2-205ENST00000559406 1799 ntTSL 517.31■□□□□ 0.362e-14■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.347e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ZFYVE21-210ENST00000556610 364 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-14■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 315.86■□□□□ 0.137e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 515.72■□□□□ 0.117e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.097e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 ZFYVE21-206ENST00000554630 566 ntTSL 215.37■□□□□ 0.052e-14■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 215.25■□□□□ 0.037e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 215.17■□□□□ 0.027e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 415.17■□□□□ 0.027e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 215.01□□□□□ -0.017e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 414.75□□□□□ -0.057e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.077e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 TNFAIP2-207ENST00000560562 1429 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.122e-14■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 214.09□□□□□ -0.157e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 513.97□□□□□ -0.177e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 313.97□□□□□ -0.177e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 313.55□□□□□ -0.247e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 413.49□□□□□ -0.257e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 513.46□□□□□ -0.257e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 412.99□□□□□ -0.337e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 412.77□□□□□ -0.377e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-231ENST00000551746 734 ntTSL 412.76□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-242ENST00000531953 506 ntTSL 412.58□□□□□ -0.47e-28■■■■■ 34.7
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