Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms