Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms