Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SNX13Q9Y5W8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX13Q9Y5W8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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