Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms