Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms