Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPIN2AQ99865 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms