Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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