Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms