Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC9Q8TBE3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms