Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE23Q8NDY6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms