Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms