Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC117Q8IWD4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms