Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP27Q6ZUM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP27Q6ZUM4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms