Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms