Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN1Q6NZI2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms