Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms