Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms