Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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