Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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