Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 TUS1YLR425W 3924 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 CAT2YML042W 2013 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YPP1YGR198W 2454 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YCR013CYCR013C 648 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 NTF2YER009W 378 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YER138W-AYER138W-A 105 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YGR018CYGR018C 330 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 CSE4YKL049C 690 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 CMC1YKL137W 336 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YML084WYML084W 309 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YOL150CYOL150C 312 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YOR333CYOR333C 417 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 MSS18YPR134W 807 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 PTC5YOR090C 1719 nt1.79□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 LHS1YKL073W 2646 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 IRC10YOL015W 1761 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 SEM1YDR363W-A 270 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 IRC4YDR540C 540 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 AAD16YFL057C 459 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YGL165CYGL165C 579 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YAP5YIR018W 738 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YNR021WYNR021W 1215 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 ATX2YOR079C 942 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 TOA1YOR194C 861 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 ARL3YPL051W 597 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 APA1YCL050C 966 nt1.78□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 SSQ1YLR369W 1974 nt1.78□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 MNE1YOR350C 1992 nt1.78□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 AHC2YCR082W 387 nt1.77□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YDL157CYDL157C 357 nt1.77□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.77□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 VPS63YLR261C 327 nt1.77□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 RPS22BYLR367W 393 nt1.77□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 MRPS8YMR158W 468 nt1.77□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YBL062WYBL062W 381 nt1.77□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 REV1YOR346W 2958 nt1.77□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 KAR9YPL269W 1935 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 CDC53YDL132W 2448 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 CDC50YCR094W 1176 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YDR250CYDR250C 276 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 COX6YHR051W 447 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SNC1YAL030W 354 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 UBC12YLR306W 567 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 RXT2YBR095C 1293 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SUS1YBR111W-A 291 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 MYO2YOR326W 4725 nt1.76□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YNL144CYNL144C 2223 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 VPS34YLR240W 2628 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 VPS41YDR080W 2979 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 CFT2YLR115W 2580 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 KAR1YNL188W 1302 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YGR242WYGR242W 309 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 MSL1YIR009W 336 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 RPA34YJL148W 702 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SPR2YOR214C 711 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 ADF1YCL058W-A 342 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 VTC3YPL019C 2508 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.75□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YOR093CYOR093C 4947 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SLS1YLR139C 1932 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YDR018CYDR018C 1191 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 RPL37BYDR500C 267 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YJL147CYJL147C 1149 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 ASG7YJL170C 630 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 RAM2YKL019W 951 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 URA5YML106W 681 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YOL106WYOL106W 354 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 HCS1YKL017C 2052 nt1.74□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SSF2YDR312W 1362 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YDR341CYDR341C 1824 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YDR199WYDR199W 366 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SDL1YIL167W 633 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SRP21YKL122C 504 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YLR053CYLR053C 327 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SWM2YNR004W 441 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SSY1YDR160W 2559 nt1.73□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 YMR045CYMR045C 5268 nt1.72□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 NCL1YBL024W 2055 nt1.72□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 HRI1YLR301W 735 nt1.72□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 SYH1YPL105C 2550 nt1.72□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 PET309YLR067C 2898 nt1.72□□□□□ -2.13
MSH5Q12175 NAM7YMR080C 2916 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YDL163WYDL163W 303 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 TSA2YDR453C 591 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YJL086CYJL086C 369 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 TEN1YLR010C 483 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SMD3YLR147C 306 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SIP18YMR175W 240 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 VAM3YOR106W 852 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YOR169CYOR169C 465 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 HSH155YMR288W 2916 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 RPN3YER021W 1572 nt1.71□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 UBP1YDL122W 2430 nt1.7□□□□□ -2.14
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