Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms