Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms