Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX6P78412 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX6P78412 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX6P78412 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX6P78412 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX6P78412 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX6P78412 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX6P78412 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX6P78412 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX6P78412 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IRX6P78412 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IRX6P78412 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IRX6P78412 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX6P78412 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX6P78412 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX6P78412 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX6P78412 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX6P78412 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX6P78412 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX6P78412 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX6P78412 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms