Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNRPNP63162 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNRPNP63162 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNRPNP63162 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNRPNP63162 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNRPNP63162 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNRPNP63162 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNRPNP63162 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms