Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PAX9P55771 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX9P55771 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX9P55771 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms