Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHBP55084 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHBP55084 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHBP55084 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHBP55084 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHBP55084 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHBP55084 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HADHBP55084 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HADHBP55084 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms