Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AP2S1P53680 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP2S1P53680 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP2S1P53680 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms