Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms