Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms