Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZEB1P37275 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ZEB1P37275 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms