Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CASQ1P31415 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CASQ1P31415 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CASQ1P31415 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CASQ1P31415 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CASQ1P31415 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CASQ1P31415 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CASQ1P31415 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CASQ1P31415 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CASQ1P31415 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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