Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A1P13866 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms