Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODC1P11926 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ODC1P11926 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ODC1P11926 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ODC1P11926 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ODC1P11926 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODC1P11926 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms