Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA4P06727 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA4P06727 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA4P06727 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA4P06727 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA4P06727 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA4P06727 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA4P06727 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA4P06727 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA4P06727 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA4P06727 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA4P06727 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA4P06727 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA4P06727 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOA4P06727 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOA4P06727 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA4P06727 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms