Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD4P01730 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD4P01730 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD4P01730 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD4P01730 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD4P01730 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms