Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUBNO60494 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUBNO60494 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUBNO60494 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUBNO60494 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUBNO60494 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUBNO60494 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUBNO60494 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUBNO60494 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUBNO60494 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUBNO60494 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUBNO60494 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms