Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms